アンノウンにより研究施設が攻撃される。多くの人々が殺戮される中、超能力を使って2人の少年少女が逃亡した。通報を受けて現場に急行したG3-Xも一足及ばず、研究所は破壊され少年たちの行方もわからなくなっていた…。