ガルガンティアは沈没船を引き揚げ、結果豊富な資材を手に入れる。その中には旧文明の記録媒体もあり、マシンキャリバーの祖となる戦闘機械に関するデータが記されていた。一方、改修を繰り返すガルガンティアは物資不足が問題視され、人々は疲弊し、慰労のために海上貿易拠点“竜宮城”に寄港することに。そんな状況で、リーマが本当の目的を明らかにし、謎のロボット・マズルもその全貌が公になる。そしてレドは、思いも寄らない真実にたどり着き……。