ジョン・キャメロン・ミッチェル監督と多数の個性派ミュージシャンたちが、トランスジェンダーの青少年の学校「ハーヴェイ・ミルク・ハイスクール」の支援に立ち上がる。それは『ヘドウィグ・アンド・アングリーインチ』の楽曲をカバーし、チャリティー・アルバムを作ること。アルバム制作の模様と、4人の生徒たちの生い立ちや抱負を映し出していく。