若く美貌の日本人女性・蝶々(エルモネラ・ヤオ)は、長崎でアメリカ人士官ピンカートン(マルセロ・プエンテ)と結婚して幸せに暮らしていた。だが、日本での任務終了に伴い夫が単身祖国へ帰ることになり、彼女の幸福な日々は終わりを迎える。蝶々は幼い息子と共に夫の帰りを待ちわび、やがて3年の月日が流れ夫は戻ってくるが……。