ついに未知の外宇宙へと出発したヤマト。大ガミラス帝星の総統、デスラーがヤマトにわなを仕掛けるも、沖田の判断で絶体絶命の危機をかわすことに成功する。そんな中、捕えたガミラスの機械化兵・オルタを同じロボットであるAU09(アナライザー)が分析することに。しかし、真田らは機械のオルタを捕虜として扱うよう意見し……。